IDENTIFIKASI KAPANG ENDOFIT DARI KULIT BATANG Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. MENGGUNAKAN SEKUEN DNA DAERAH ITS

• Main Author: Dewani Tediana Yusepany, - (Author)
• Format: Book
• Published: 2018-08-29.
• Subjects: Thesis; NonPeerReviewed
• Online Access: Link Metadata

Summary

Kapang endofit memiliki potensi yang besar dalam menghasilkan senyawa yang mirip dengan tanaman inangnya dan menjadi sumber alternatif dalam pengembangan ilmu pengetahuan, salah satunya di bidang medis. Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. dikenal sebagai penghasil senyawa antikanker, yaitu taxol. Kapang endofit dari Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. diduga dapat menghasilkan senyawa yang sama seperti senyawa yang dihasilkan oleh Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi kapang endofit yang berasal dari kulit batang Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. dengan menggunakan marka molekuler sekuen DNA daerah ITS (Internal Transcribed Spacer). Dua puluh kapang endofit dikarakterisasi. Amplifikasi DNA daerah ITS menggunakan primer ITS-1 dan ITS-4. Hasil sekuensing DNA kapang endofit berhasil dicontig dengan progran Codoncode Aligner. Hasil BLAST menunjukkan dua belas kapang teridentifikasi dengan nama spesies yang berbeda yaitu Neofusicoccum parvum, Aspergillus versicolor, A. unguis, Penicilium chrysogenum, P. commune, P. rubens, Neopestalotiopsis sp., Clonostachys sp., Fusarium striatum, F. solani, Peniophora sp. dan Aporospora sp., satu diantaranya merupakan anggota dari filum Basidiomycota, sedangkan sisanya merupakan anggota dari filum Ascomycota. Analisis kekerabatan dilakukan dengan penjajaran sekuen menggunakan program ClustalX. Rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan program PAUP*4b10 dengan metode Maximum Parsimony menghasilkan tujuh kelompok kapang endofit yang didominasi oleh familia dari filum Ascomycota. ..... Endophytic fungi have great potential in producing components similar to their host plants and are an alternative in the medical field. Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. known as a producer of anticancer compounds, namely taxol. Endophytic fungi from Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. can produce the same components produced by Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. The purpose of this study was to find endophytic fungi derived from the bark of Taxus sumatrana (Miquel) de Laub. by using molecular markers of the DNA sequence of the ITS region (Internal Transcribed Spacer). Twenty endophytic fungi were characterized. DNA amplification of the ITS region using ITS-1 and ITS-4 primers. The results of endophytic fungi DNA sequencing were successfully contig with the Codoncode Aligner program. BLAST results showed that twelve fungi were identified by the names of different species namely Neofusicoccum parvum, Aspergillus versicolor, A. unguis, Penicilium chrysogenum, P. commune, P. rubens, Neopestalotiopsis sp., Clonostachys sp., Fusarium striatum, F. solani, Peniophora sp. and Aporospora sp., is a member of the phylum Basidiomycota, while a reserve of the Ascomycota phylum. Phylogenetic analysis is done by aligning sequences using the ClustalX program. Phylogenetic tree reconstruction using the PAUP*4b10 program with the Maximum Parsimony method produced seven groups of endophytic fungi released by families of the Ascomycota phylum.

Item Description

http://repository.upi.edu/41118/1/S_BIO_1400970_Title.pdf
http://repository.upi.edu/41118/2/S_BIO_1400970_Tabel_of_Content.pdf
http://repository.upi.edu/41118/3/S_BIO_1400970_Abstract.pdf
http://repository.upi.edu/41118/4/S_BIO_1400970_Chapter1.pdf
http://repository.upi.edu/41118/5/S_BIO_1400970_Chapter2.pdf
http://repository.upi.edu/41118/6/S_BIO_1400970_Chapter3.pdf
http://repository.upi.edu/41118/7/S_BIO_1400970_Chapter4.pdf
http://repository.upi.edu/41118/8/S_BIO_1400970_Chapter5.pdf
http://repository.upi.edu/41118/9/S_BIO_1400970_Biography.pdf
http://repository.upi.edu/41118/10/S_BIO_1400970_Appendix.pdf