Recovery of Norovirus from lettuce (Lactuca sativa) using an adsorption -elution method with a negatively charged membrane: comparison of two elution buffers / Recuperação de Norovirus a partir de alface (Lactuca sativa) utilizando um método de adsorção-eluição com membrana negativamente carregada - comparação de dois tampões de eluição

Phosphate saline buffer (PBS) and glycine buffer (GB) were evaluated as elution buf-fers in an adsorption-elution method using a negatively charged membrane associated with quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and semi-nested PCR for detection of Norovirus genogroup II (NoV GII) from lettuc...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: Marcelo Luiz Lima Brandão (Author), Davi de Oliveira Almeida (Author), Victor Augustus Marin (Author), Marize Pereira Miagostovich (Author)
Format: Book
Published: Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), 2014-08-01T00:00:00Z.
Subjects:
Online Access:Connect to this object online.
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Description
Summary:Phosphate saline buffer (PBS) and glycine buffer (GB) were evaluated as elution buf-fers in an adsorption-elution method using a negatively charged membrane associated with quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and semi-nested PCR for detection of Norovirus genogroup II (NoV GII) from lettuce. In this methodology, PP7 bacterio-phage was used as a virus sample for process control. The qPCR showed more sensitivity than semi-nested PCR for NoV GII detection. The recovery efficiency, using PBS and GB, ranged from 24.72 to 60.78% and 19.48 to 137.26% for NoV GII, and from 0.01 to 0.15% and 0.13 to 6.04% for PP7 bacteriophage, respectively. Elution with GB was more effi-cient for PP7 bacteriophage recovery (p = 0.03), but no difference was seen for NoV GII (p = 0.57). The GB performed better than PBS as an eluent solution and can be consid-ered a methodological improvement. ---------------------------------------------------------------------------------------- Salina tamponada fosfatada (STF) e tampão glicina (TG) foram avaliados como eluentes em um método de adsorção-eluição, utilizando membrana carregada negativamente associada com reação quantitativa de polimerase em cadeia (qPCR) e semi-nested PCR, para detecção de Norovírus do genogrupo II (NoV GII) a partir de alface. Nesta metod-ologia, o bacteriófago PP7 foi utilizado como controle do processo. A qPCR apresentou maior sensibilidade do que o semi-nested PCR na detecção de NoV GII. A eficiência de recuperação, utilizando STF e TG, variou de 24,72 a 60,78% e de 19,48 a 137,26% para NoV GII e de 0,01 a 0,15% e de 0,13 a 6,04% para o bacteriófago PP7, respectivamente. A eluição com TG foi mais eficiente na recuperação do bacteriófago PP7 (p = 0,03) em-bora nenhuma diferença tenha sido observada para NoV GII (p = 0,57). O TG apresentou melhor desempenho que a STF como solução para eluição e pode ser considerada uma melhoria do método.
Item Description:10.3395/vd.v2i3.195
2317-269X